Jmolヘルプ

Jmol_filterの使用を手伝ってください

Jmolマウスコントロール

1ボタン（Macintoshなど）、2ボタン（Windowsなど）、3ボタン（Linuxなど）、ホイールマウス用のJmolコントロール。

アクション	メイン（左）ボタン	中央ボタン	二次（右）ボタン
Jmolメニュー	Jmolのロゴをクリック または Ctrl +クリック		クリック
X、Yを回転	クリック＆ドラッグ
X、Yを翻訳	Shift +ダブルクリック＆ドラッグ	ダブルクリック＆ドラッグ	Ctrl +クリック＆ドラッグ
Zを回転	Shift +クリックして水平方向にドラッグ	水平にクリック＆ドラッグ	Shift +クリックして水平方向にドラッグ
ズーム	Shiftキーを押しながらクリックして垂直方向にドラッグ	上下にクリック＆ドラッグ またはマウスホイール
リセット＆中央揃え	Shift +ダブルクリック（分子から離れる）	ダブルクリック（分子から離れて）
Jmolのサイズ変更	右下隅をクリックしてドラッグ

Jmol測定

• 2原子間の距離：

1. 開始原子をダブルクリック
2. 距離測定を修正するには、2番目の原子をダブルクリックします

• 3原子間の角度：

1. 開始原子をダブルクリック
2. 2番目の原子をクリックします（角度の中心の原子）
3. 角度測定を修正するには、3番目の原子をダブルクリックします

• 4原子間のねじれ角または二面角

1. 開始原子をダブルクリック
2. 2番目の原子をクリック
3. 3番目の原子をクリックしてください。</p>
4. 二面角測定を修正するには、4番目の原子をダブルクリックします

• すべての場合において
  • 恒久的な測定値を残さずに測定結果を見るために、移動先の原子の上にポインタを移動します。
  • 測定をキャンセルするには、ウィンドウの外側に移動します
  • 測定を削除するには、同じ測定をもう一度行います。

Jmolのデフォルト色

要素：CPKカラースキーム

任意の要素の上にカーソルを置くと詳細情報が表示されます（原子番号、記号、要素名）

1	2	3	4	5	6	7	8	9	10年	11	12年	13年	14年	15年	16	17年	18年
H																	彼
李	ある											B	C	N	○	F	ね
な	Mg											アル	Si	P	S	Cl	Ar
K	Ca	Sc	Ti	V	Cr	Mn	Fe	Co	Ni	Cu	Zn	Ga	Ge	として	Se	Br	Kr
Rb	Sr	Y	Zr	Nb	月	Tc	る	Rh	Pd	Ag	Cd	に	Sn	Sb	て	私	Xe
Cs	Ba	*	Hf	タ	W	再	オス	Ir	Pt	Au	Hg	Tl	Pb	バイ	ポー	で	Rn
Fr	ラ	**	Rf	Db	SG	Bh	Hs	山	Ds	Rg	Cn
	*	ラ	Ce	Pr	Nd	午後	Sm	EU	Gd	Tb	Dy	ホー	えー	Tm	Yb	呂
	**	交流	Th	Pa	U	Np	Pu	午前	CM	Bk	CF	Es	FM	Md	いいえ	Lr

生体高分子

一次構造

アミノ酸残基：アミノカラースキーム

アラ

Arg

Asn

Asp

シス

Gln

グル

Gly

彼の

イル

ルー

リス

会った

Phe

プロ

Ser

Thr

Trp

Tyr

ヴァル

Asx

Glx

Xxx

アミノ酸残基：見栄えのする配色

アラ

Arg

Asn

Asp

シス

Gln

グル

Gly

彼の

イル

ルー

リス

会った

Phe

プロ

Ser

Thr

Trp

Tyr

ヴァル

Asx

Glx

Xxx

ヌクレオチド塩基残基：見栄えのする配色

A

G

私

C

T

U

二次構造

ポリペプチド、核酸および炭水化物

αらせん

3 10らせん

πらせん

β鎖

（β）ターン

その他の

DNA

RNA

その他の

炭水化物

その他の

三次構造

ポリペプチドと核酸

N末端または5'-

C末端または3'-

もっと

詳しくは以下を参照してください。

Jmol

Jmol Wiki

Jmolスクリプティングリファレンス